Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms