Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RRN3P1Q2M238 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms