Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC142Q17RM4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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