Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP6Q16828 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms