Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTN1Q16799 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTN1Q16799 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms