Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLPPQ16740 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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