Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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