Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC6Q16204 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC6Q16204 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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