Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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