Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA2Q15822 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA2Q15822 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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