Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms