Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRADDQ15628 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRADDQ15628 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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