Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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IRF4Q15306 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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IRF4Q15306 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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