Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB35Q15286 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB35Q15286 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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