Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRKQ15262 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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