Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRRQ15256 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRRQ15256 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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