Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms