Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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RAB39AQ14964 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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RAB39AQ14964 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RAB39AQ14964 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RAB39AQ14964 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB39AQ14964 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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