Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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