Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms