Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PEX6Q13608 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PEX6Q13608 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PEX6Q13608 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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