Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms