Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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