Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3B2Q13367 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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