Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM28Q13263 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM28Q13263 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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