Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms