Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RASGEF1BQ0VAM2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms