Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIPAL4Q0D2K0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms