Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRSF4Q08170 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms