Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms