Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms