Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP7AQ04656 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms