Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms