Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms