Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COG7P83436 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG7P83436 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG7P83436 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG7P83436 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms