Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX1P78337 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX1P78337 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX1P78337 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms