Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P63132 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms