Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms