Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVS71-1P61550 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms