Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CABP4P57796 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABP4P57796 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms