Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCBP3P57721 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms