Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP7P55210 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP7P55210 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP7P55210 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP7P55210 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms