Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCC3P46736 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms