Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RANGAP1P46060 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RANGAP1P46060 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms