Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIK3CBP42338 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms