Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC1P41238 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms