Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPA9P38646 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPA9P38646 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms