Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms