Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM23P36406 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM23P36406 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms