Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPS1P31327 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPS1P31327 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms